- Marrëveshje midis Qeverisë së Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi mbi problemet ujore, Statuti i Komisionit të përbashkët ndërqeveritar shqiptaro malazez për trajtimin e ujërave kufitare, si dhe Protokolli i mbledhjes së këtij Komisioni, nënshkruar më 31.10.2001, hyrë në fuqi më 13.2.2003.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Republikës së Malit të Zi, për bashkëpunimin në fushën e luftës kundër krimit të organizuar dhe trafikut të paligjshëm dhe aktiviteteve të tjera kriminale, nënshkruar më 31.10.2003.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi, mbi transportin ndërkombëtar rrugor të udhëtarëve dhe mallrave, nënshkruar më 2.7.2004, hyrë në fuqi më 11.11.2004.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi, për vendosjen e linjës ndërkombëtare liqenore për udhëtarë, Shkodër-Virpazar, nënshkruar në Podgoricë, më datë 2.7.2004.
- Memorandum mirëkuptimi ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Republikës së Malit të Zi për shfrytëzimin e LTL 400 KV, nënshkruar më 2.7.2004.
- Protokoll ndërmjet Qeverisë së Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi për bashkëpunimin në fushën e shëndetësisë dhe shkencave mjekësore, nënshkruar më 10.11.2004.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Republikës së Malit të Zi për bashkëpunim të ndërsjellë në çështjet doganore, nënshkruar më 23.12.2005, hyrë në fuqi më 1.12.2007.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi, për organizimin e trafikut hekurudhor ndërmjet dy vendeve, nënshkruar më 16.5.2006.
- Memorandum mirëkuptimi ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi për zhvillimin ndërkufitar të Liqenit të Shkodrës nënshkruar më 26.5.2006.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi për hapjen e pikës së përbashkët kufitare MuriqanSukobinë, nënshkruar më 17.1.2007, hyrë në fuqi më 24.5.2007.
- Marrëveshje ndërmjet Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi mbi bashkëpunimin shkencor dhe teknologjik, nënshkruar më 16.12.2008.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Republikës së Malit të Zi mbi bashkëpunimin policor ndërkufitar, nënshkruar më 1.2.2008.
- Protokoll ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi për kryerjen e veprimtarive të përbashkëta të kontrollit kufitar në piken e përbashkët të kalimit kufitar Muriqan-Sukobin, nënshkruar më 18.6.2009, hyrë në fuqi më 28.1.2010.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë Malit të Zi mbi lëvizjen e ndërsjellë të shtetasve, nënshkruar më 6.11.2009, hyrë në fuqi më 15.2.2010.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë Malit të Zi për ripranimin e personave me qëndrim të paautorizuar, nënshkruar më 6.11.2009, hyrë në fuqi më 17.3.2011.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë Malit të Zi për riparimin, rindërtimin dhe mirëmbajtjen e piramidave dhe shenjave të tjera kufitare në kufirin shtetëror shqiptaro – malazez, nënshkruar më 6.11.2009, hyrë në fuqi më 8.9.2010.
- Ndryshimi i Marrëveshjes ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi mbi lëvizjen e ndërsjellë të shtetasve, nënshkruar më 14.12.2011, hyrë në fuqi më 21.3.2012.
- Marrëveshje për përcaktimin e pikës së përbashkët të kalimit kufitar Zatrijebacka Cijevna-Grabon për trafikun ndërkombëtar të pasagjerëve dhe për pikën e kalimit kufitar Cerem-Vranica midis Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi, nënshkruar më 25.1.2012, hyrë në fuqi më 20.2.2013.
- Marrëveshja ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi, mbi kryerjen e transportit hekurudhor kufitar ndërmjet të dy vendeve, nënshkruar më Podgoricë, më datë 3.8.2012, hyrë në fuqi më 2.5.2013.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi mbi mbrojtjen e ndërsjellë të informacionit të klasifikuar, nënshkruar në Tiranë, më 11.3.2013, hyrë në fuqi më 17.6.2013.
- Marrëveshje bashkëpunimi në fushën e arsimit ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi, nënshkruar në Tiranë, më 11.3.2013, hyrë në fuqi më 28.2.2014.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi mbi njohjen e ndërsjellë të lejeve të drejtimit, nënshkruar më 15.12.2014, hyrë në fuqi më 7.4.2015.
- Memorandum bashkëpunimi ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi për bashkëpunimin në fushën e teknologjisë së informacionit dhe komunikimit, nënshkruar më 17.4.2015, hyrë në fuqi ditën e nënshkrimit.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi mbi bashkëpunimin ekonomik, nënshkruar më 23.2.2015, hyrë në fuqi më 20.11.2015.
- Marrëveshje bashkëpunimi ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi në kontekstin e anëtarësimit në Bashkimin Europian, nënshkruar në Tiranë, më 22.5.2015, hyrë në fuqi më 16.12.2015.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi mbi bashkëpunim dhe ndihmë të ndërsjellë në emergjenca, nënshkruar në Shkodër, më 3.7.2018, hyrë në fuqi më 22.11.2018.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi në lidhje me operacionet ndërkufitare të patrullimit ajror, nënshkruar në Shkodër, më 3.7.2018.
- Marrëveshje kuadër ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi për marrëdhëniet e ndërsjella në menaxhimin e burimeve ujore ndërkufitare, nënshkruar në Shkodër, më 3.7.2018, hyrë në fuqi më 28.12.2018.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi për hapjen e Pikës së Përbashkët të Kalimit Kufitar Zogaj (Republika e Shqipërisë) – Skje (Mali i Zi) për qarkullimin ndërkombëtar rrugor dhe të pasagjerëve në liqenin e Shkodrës, nënshkruar në Shkodër, më 3.7.2018, hyrë në fuqi më 12.12.2018.
- Marrëveshje ndërmjet Republikës së Shqipërisë dhe Malit të Zi për sigurimet shoqërore dhe Marrëveshje administrative për zbatimin e Marrëveshjes ndërmjet Republikës së Shqipërisë dhe Malit të Zi për sigurimet shoqërore, nënshkruar në Podgoricë, më 27.2.2023.
- Marrëveshje dypalëshe ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi për ndërtimin e urës ndërkufitare mbi lumin Buna/Bojana, nënshkruar në Podgoricë, më 27.2.2023.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi për hapjen e pikës së përbashkët të kalimi kufitar Shën Nikolla-Pulaj për qarkullimin rrugor ndërkombëtar dhe kryerjen e veprimtarive të përbashkëta të kontrollit kufitar, nënshkruar në Podgoricë, më 27.2.2023.
- Marrëveshje ndërmjet Këshillit të Ministrave të Republikës së Shqipërisë dhe Qeverisë së Malit të Zi mbi bashkëpunimin në fushën e mbrojtjes së bimëve, nënshkruar në Podgoricë, më 27.2.2023.